Eξελίξεις που αφορούν το εθνικό σύστημα επιτήρησης του SARS-CoV-2 και των παραλλαγών του στα λύματα

/στην κατηγορία

PULSE: To κυπριακό δίκτυο παρακολούθησης αστικών λυμάτων για τον κορονοϊό και τις παραλλαγές του, το οποίο συμπληρώνει την παραδοσιακή παρακολούθηση του ιού που ήδη υπάρχει στην Κύπρο και βασίζεται σε κλινικά επιβεβαιωμένες περιπτώσεις ατόμων με COVID-19. Δημιουργήθηκε από τη φράση ‘Pancyprian sUrveilLance of SARS-CoV-2 in urban wastEwater’ και στόχος του είναι η συστηματική παρακολούθηση της παρουσίας επιλεγμένων γενετικών δεικτών του ιού SARS-CoV-2 και των πιο διαδεδομένων παραλλαγών του στα αστικά λύματα, προκειμένου να βελτιωθεί η κατανόηση της δυναμικής και των χωροχρονικών τάσεων της πανδημίας COVID-19.

Οι τέσσερις κύριες δραστηριότητες του PULSE που πραγματοποιούνται κατά την περίοδο Οκτωβρίου 2021-Σεπτεμβρίου 2022 είναι:

  • Ανίχνευση και ποσοτικοποίηση των γενετικών δεικτών του SARS-CoV-2 που κωδικοποιούν για τη σύνθεση των πρωτεϊνών νουκλεοκαψιδίου (γενετικός δείκτης Ν2) και φακέλου (γενετικός δείκτης Ε) στα αστικά λύματα, μετά από τη συστηματική δειγματοληψία σύνθετων 24-ωρων δειγμάτων, αντιπροσωπευτικών της προηγούμενης ημέρας, από τις κύριες μονάδες επεξεργασίας λυμάτων στις αστικές περιοχές της Κύπρου (Σταθμοί Ανθούπολης και Βαθιάς Γωνιάς [Λευκωσία], Μονής [Λεμεσός], Λάρνακας, Πάφου, καθώς και Αντλιοστάσια λυμάτων Παραλιμνίου και Αγίας Νάπας).
  • Επιδημιολογική ανάλυση των δεδομένων που προέρχονται από τα λύματα και συσχέτισή τους με τα δεδομένα από το σύστημα επιτήρησης ασθενών με COVID-19 (π.χ. ημερήσιες διαγνώσεις λοιμώξεων και συνολικός αριθμός διαγνώσεων SARS-CoV-2 για μια συγκεκριμένη περίοδο, κ.λπ.) σε κάθε πόλη της Κύπρου, προκειμένου να αξιολογηθεί η δυναμική μετάδοσης του SARS-CoV-2.
  • Μηνιαίος προσδιορισμός των πιο διαδεδομένων παραλλαγών του SARS-CoV-2 στα αστικά λύματα. Η ανάλυση αυτή είναι πιθανό να αντικατοπτρίζει τις παραλλαγές που κυκλοφορούν στην κοινότητα την εν λόγω περίοδο.
  • Ανάπτυξη ψηφιακής πλατφόρμας για την καταχώριση των αποτελεσμάτων της επιτήρησης λυμάτων, για την παρακολούθηση της πανδημίας και ενημέρωση του κοινού

 

Δείτε μέσω της ψηφιακής πλατφόρμας https://covid-pulse.cy/ τις εβδομαδιαίες συγκεντρώσεις αντιγράφων γονιδίων του  SARS-CoV-2 στα αστικά λύματα, για κάθε πόλη.

 

 Ποιοι συμμετέχουν στο Έργο;

Στο PULSE συμμετέχει μια μεγάλη ερευνητική ομάδα με επιστήμονες με διαφορετικά επιστημονικά υπόβαθρα και τεχνογνωσία:

  • Το Διεθνές Ερευνητικό Κέντρο Νερού Νηρέας (www.nireas-iwrc.org) του Πανεπιστημίου Κύπρου, είναι υπεύθυνο για τον προσδιορισμό των γενετικών θραυσμάτων SARS-CoV-2 στα αστικά λύματα, καθώς και για την επιδημιολογική ανάλυση των συγκεντρώσεων SARS-CoV-2 στα αστικά λύματα σε σχέση με τα κλινικά δεδομένα COVID-19. Είναι ο γενικός Συντονιστής του Έργου.
  • Το Κέντρο Αριστείας και για Έρευνα και Καινοτομία ΚΟΙΟΣ (KIOS CoE) του Πανεπιστημίου Κύπρου, είναι υπεύθυνο για την ανάπτυξη της ψηφιακής πλατφόρμας παρακολούθησης του SARS-CoV-2.
  • Το Τμήμα Μοριακής Ιολογίας του Ινστιτούτου Νευρολογίας και Γενετικής Κύπρου που ασχολείται με τον εντοπισμό των πιο διαδεδομένων παραλλαγών του SARS-CoV-2 στα αστικά λύματα.

Το Έργο χρηματοδοτείται από το Τμήμα Αναπτύξεως Υδάτων του Υπουργείου Γεωργίας, Αγροτικής Ανάπτυξης και Περιβάλλοντος και το Τμήμα Ιατρικών Υπηρεσιών και Υπηρεσιών Δημόσιας Υγείας του Υπουργείου Υγείας, της Κυπριακής Δημοκρατίας.

Σημειώνεται ότι το Τμήμα Αναπτύξεως Υδάτων έχει λάβει χρηματοδότηση από την Ευρωπαϊκή Επιτροπή για το συντονισμό της ανάπτυξης του δικτύου συστηματικής επιτήρησης του SARS-CoV-2 και των παραλλαγών του στα αστικά λύματα της Κύπρου, μέσω χρηματοδοτικού μηχανισμού που προέκυψε από τη Σύσταση (ΕΕ) 2021/472 της Ευρωπαϊκής Επιτροπής.